#Fungal Manipulation #PlantFungiInteraction #SymbioticFungi #PathogenicFungi #ProteinStructures #AMFungi #EffectorProteins #PlantHealth #Agriculture #AlphaFold2 #PlantMicrobeInteractions #GatsbyCharitableFoundation #SLCU
Tha luchd-saidheans aig Saotharlann Sainsbury Oilthigh Chambridge (SLCU) air lorg ùr-nodha a dhèanamh, a’ nochdadh gu bheil fungasan symbiotic agus pathogenic, a dh’ aindeoin a bhith càirdeach fad às, a’ cleachdadh buidheann coltach de phròtainean airson a bhith a’ làimhseachadh agus a’ fuireach ann an lusan. Tha an rannsachadh seo, a rinn coimeas eadar pròtanan dìomhair bho na fungasan sin a’ cleachdadh teicneòlas adhartach AI, a’ tilgeil solas air na h-innealan a tha mar bhunait air eadar-obrachadh fungasan planntrais. Tha buaidh mhòr aig na co-dhùnaidhean air àiteachas agus eag-shiostaman nàdarra, oir dh’ fhaodadh tuigse fhaighinn air na h-innealan moileciuil sin dàimhean fungasan planntrais a leasachadh agus aig an aon àm a bhith nan cunnart bho bhith nas buailtiche do pathogens.
Tha Sebastian Scornack agus an sgioba rannsachaidh aige aig SLCU gu sònraichte airson a bhith ag aithneachadh agus a’ comharrachadh luchd-buaidh mycorrhiza arbuscular ùr (AM), a tha nam pròtainean a tha air an dìomhair le fungasan symbiotic gus an tuineachadh air freumhaichean planntrais. Anns an oidhirp aca na ro-innleachdan a tha air an cleachdadh le fungasan pathogenic agus symbiotic fhuasgladh, chleachd an sgioba prògram coimpiutair AlphaFold2 AI, inneal cumhachdach airson structaran pròtain a ro-innse. Leig seo leotha coimeas a dhèanamh eadar pròtanan dìomhair fungasan symbiotic agus pathogenic, agus aig a’ cheann thall chaidh buidheann de phròtainean coltach ri structar a lorg air an còdachadh ann an genomes an dà sheòrsa fungas.
Tha buaidh fharsaing aig toraidhean an sgrùdaidh air slàinte planntrais agus àiteachas. Tha pàirt deatamach aig fungasan symbiotic, leithid fungasan AM, ann an gabhail beathachaidh, brosnachadh fàs planntrais, agus dìon an aghaidh pathogens. Air an làimh eile, tha fungasan pathogenic, leithid Fusarium oxysporum, nam pathogenan millteach a tha a’ bagairt bàrr cudromach leithid bananathan agus pailmean ola. Tha comharrachadh pròtainean co-roinnte, ris an canar pròtainean dà-àrainn Fusarium oxysporum lycopersici (FOLDs), a’ moladh gu bheil na pròtanan sin a’ cur ri comas an dà chuid fungasan symbiotic agus pathogenic a bhith a’ fuireach ann am planntrais gu soirbheachail.
Tha an Dr. Schornack a’ cur cuideam air ged a dh’ fhaodadh a bhith ag àrdachadh dàimhean AM ann am bàrr na bhuannachd do fhàs planntrais, dh’ fhaodadh e cuideachd am so-leòntachd a thaobh pathogens a mheudachadh. Tha an lorg seo a’ togail cheistean mu làthaireachd agus gnìomh nam pròtanan sin ann am fungasan symbiotic agus a’ bhuaidh a dh’ fhaodadh a bhith aige air eadar-obrachaidhean planntrais-microbe.
Tha tuigse air iomadachd agus coltachd luchd-buaidh a bhios an dà chuid symbionts agus pathogens a’ cleachdadh deatamach airson a bhith a’ faighinn a-mach iom-fhillteachd eadar-obrachaidhean planntrais-microbe. Ged a tha pròtanan buaidh ann an dàimhean planntrais-patogen air an deagh sgrùdadh, chan eil mòran eòlais againn air eadar-obrachaidhean planntrais-symbiont, leithid an fheadhainn anns a bheil fungasan AM. Tha a bhith a’ faighinn a-mach na diofar luchd-buaidh a tha an lùib a’ chàirdeis planntrais-symbiont na phrìomh fhòcas ann an rannsachadh Sgioba Schornack a tha a’ dol air adhart.
Chaidh an rannsachadh ùr-nodha seo a dhèanamh comasach tro mhaoineachadh bhon Gatsby Charitable Foundation, an Comann Rìoghail, agus Comhairle Rannsachaidh na h-Eòrpa.